勘查实施方案制度最早出台于1998年，国务院颁布了《矿产资源勘查区块登记管理办法》（国务院第240）中明确将“勘查实施方案及其附件”列入探矿权人申请探矿权时的要件。2009年，国土资源部《关于进一步规范探矿权管理有关问题的通知》（国土资发〔2009〕200号）中，要求探矿权人需要按照勘查实施方案进行勘查施工。此外，也首次明确要求了省级以上登记管理机关应组织专家对探矿权申请人提交勘查实施方案进行审查。由于没有方案编制和审查的明确且统一的要求，部分省份出现标准不一、粗制滥造、随意而为、内容虚假等问题。这为一些地区找矿秩序的混乱埋下了伏笔，同时也使勘查实施方案制度流于形式。